这里有两个解决方案：

　　1.安装Linux后安装WIN 2000 

　　首先，需要重新安装LILO。打开/etc/lilo.conf文件，找到boot=/dev/hda行，把hda改为Linux所在分区(比如Linux安在第一块硬盘的第二分区，那么就改成hda2,余类推)，保存 
改动，执行lilo命令。用mkbootdisk命令制作一张启动盘(多做几张，以备不测)。在执行dd if=/dev/hda2 of=/tmp/bootsect.lnx bs=512 count=1; mcopy /tmp/bootsect.lnx a: (软区里要有一张用DOS格过的软盘)，取出软盘，插入win98启动盘。重新启动计算机，用win98启动盘进入DOS，执行fdisk/mbr命令。取出软盘，重新启动计算机，应该显示缺少系统盘。插入win2000光盘，重启机子，安装吧。安好后，将bootsect.lnx文件拷到C盘跟目录下，编辑c:oot.ini文件(是隐藏的和只读的，需要去掉该属性)，增加一行c:ootsect.lnx="Linux"保存，重启机子，应该能选择进哪个系统了吧。

　　2.还有另一套方案供参考

　　我的硬盘上安装有三套操作系统，WIN2000，WIN ME，红旗Linux。如果你也想装WIN ME的话，要先装WIN ME，再装WIN 2000，最后装Linux。Linux的LILO安装在MRB中就行了。启动时，在LILO的界面上按TAB键，你可以看到两个可以启动的系统，如果没有修改的话是DOS Linux，键入DOS，就可以启动WIN2000了！